Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms