Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms