Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IHHQ14623 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IHHQ14623 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IHHQ14623 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IHHQ14623 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IHHQ14623 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IHHQ14623 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IHHQ14623 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IHHQ14623 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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