Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ALKBH1Q13686 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms