Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms