Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms