Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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