Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms