Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms