Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX1P83916 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX1P83916 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX1P83916 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX1P83916 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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