Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNA1P78396 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA1P78396 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms