Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB4BP68371 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms