Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ELLP55199 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ELLP55199 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms