Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PGGT1BP53609 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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