Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA3P35244 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPA3P35244 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPA3P35244 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPA3P35244 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms