Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms