Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms