Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms