Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DESP17661 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DESP17661 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms