Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEFHP12036 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms