Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms