Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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