Protein–RNA interactions for Protein: O75477

ERLIN1, Erlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN1O75477 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERLIN1O75477 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms