Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms