Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms