Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms