Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms