Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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