Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms