Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTA3Q9BTC8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms