Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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