Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms