Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms