Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFRP1Q8N474 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms