Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms