Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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