Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms