Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMBQ6PCB8 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms