Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLX4IPQ5VYV7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms