Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms