Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms