Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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