Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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