Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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ECM1Q16610 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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