Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SS18Q15532 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SS18Q15532 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SS18Q15532 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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