Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms