Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOFQ13790 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOFQ13790 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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