Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms