Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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