Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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FOXD4Q12950 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD4Q12950 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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